熒光定量試劑盒在實(shí)際操作過(guò)程中可能會(huì)遇到一些技術(shù)挑戰(zhàn)或?qū)嶒?yàn)結(jié)果不理想的情況,了解這些常見(jiàn)問(wèn)題及其相應(yīng)的解決方法,可以幫助您提高實(shí)驗(yàn)成功率并獲得可靠的檢測(cè)結(jié)果。本文將詳細(xì)介紹
熒光定量試劑盒使用中的常見(jiàn)問(wèn)題及應(yīng)對(duì)策略。

一、擴(kuò)增曲線異常
問(wèn)題描述:
擴(kuò)增曲線出現(xiàn)平臺(tái)期過(guò)早或無(wú)明顯指數(shù)增長(zhǎng)階段,甚至呈現(xiàn)平坦的基線。
可能原因:
1、引物設(shè)計(jì)不合理:引物特異性差或退火溫度不合適,導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增或擴(kuò)增效率低下。
2、模板質(zhì)量差:RNA降解、DNA污染或樣本純度不足,影響了擴(kuò)增效果。
3、試劑失效或污染:酶活性降低、dNTP濃度不足或試劑受到污染。
解決方法:
1、優(yōu)化引物設(shè)計(jì):重新設(shè)計(jì)引物,確保其特異性和擴(kuò)增效率??梢酝ㄟ^(guò)BLAST比對(duì)驗(yàn)證引物的特異性,并根據(jù)Tm值調(diào)整退火溫度。
2、提高模板質(zhì)量:使用高質(zhì)量的RNA提取試劑盒,并通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳或分光光度計(jì)檢查RNA完整性。對(duì)于DNA樣本,確保無(wú)RNA污染。
3、更換試劑:檢查試劑的有效期,必要時(shí)更換新的試劑。同時(shí),注意實(shí)驗(yàn)環(huán)境的清潔,避免交叉污染。
二、Ct值過(guò)高或過(guò)低
問(wèn)題描述:
Ct值過(guò)高(通常>35)或過(guò)低(通常<10),表明目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)低或高,影響定量準(zhǔn)確性。
可能原因:
1、模板稀釋不當(dāng):樣本濃度過(guò)高或過(guò)低,超出檢測(cè)范圍。
2、反應(yīng)體系不均衡:酶量、引物濃度或緩沖液成分不合適,導(dǎo)致擴(kuò)增效率變化。
3、設(shè)置錯(cuò)誤:熒光通道選擇錯(cuò)誤或閾值設(shè)定不合理。
解決方法:
1、優(yōu)化樣本濃度:根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果調(diào)整樣本稀釋倍數(shù),使其處于推薦的檢測(cè)范圍內(nèi)。
2、調(diào)整反應(yīng)條件:按照說(shuō)明書建議的比例配制反應(yīng)體系,確保各組分比例適當(dāng)??梢赃M(jìn)行梯度稀釋實(shí)驗(yàn),找到合適反應(yīng)條件。
3、校準(zhǔn)參數(shù):確認(rèn)熒光通道選擇正確,并根據(jù)擴(kuò)增曲線手動(dòng)調(diào)整閾值,以獲得準(zhǔn)確的Ct值。